由于PET-CT具有“精准”“高效”“超前”等众多优势，因此在临床上用途广泛，而主要的应用就在于疾病的检查方面：
一、健康高端体检 PET-CT体检的确是有别于CT、核磁等常规体检，它可以检查出2mm左右的细微肿瘤病变，提前半年以上检测出微小的细胞病变，提醒人们进行及时治疗，让身体时时处于健康状态。
二、肿瘤筛查 对于很多模棱两可的CT、核磁结果，临床上一般都会建议做PET-CT加以鉴定，它是临床上精确度最高的肿瘤筛查设备。
三、治疗辅助 PET-CT可以一目了然的检测出患者身体各个部位的病变情况(肿瘤的位置、肿瘤的恶性肿瘤、肿瘤是否转移等等)，有效提高了局部控制率，避免了不必要的手术和伤害。
四、疗效评估 手术、放疗、化疗等某种治疗后，通过PET-CT检查可以确定肿瘤是否有变化、癌细胞的活跃性是否降低、全身其他部位还有没有扩展，可以判断出之前的治疗效果，是‘可否沿袭之前的治疗方案’的重要依据，明显的提高了对症治疗率并且降低了治疗的副作用。
